Foi pouco o tempo que o apresentador passou com o pai. Este foi trabalhar para Moçambique e só regressou a Lisboa quando João Paulo tinha dez anos. Morreu pouco tempo depois, vítima de um cancro.
Receoso de que as filhas possam sofrer com a sua própria ausência, o também ator quer ser um pai presente. Custe o que custar.
“Percebi que ele não tinha estado comigo. Eu não tinha crescido com ele (…) A vida às vezes prega partidas. Não quero fazer o mesmo às minhas filhas. Quero que elas cresçam comigo, e portanto estamos juntos todos os dias”, explicou em entrevista à revista TV Guia.
João Paulo Rodrigues tem duas filhas: Rita, de oito anos, e Sofia, de três.